Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Csf2raQ00941 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Csf2raQ00941 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms