Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col8a1Q00780 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Col8a1Q00780 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms