Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gabpb1Q00420 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms