Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb4P99026 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb4P99026 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms