Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cds1P98191 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms