Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scn1bP97952 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scn1bP97952 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms