Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfdP97946 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VegfdP97946 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms