Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gfra1P97785 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfra1P97785 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms