Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cry1P97784 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cry1P97784 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cry1P97784 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cry1P97784 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms