Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Npas1P97459 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Npas1P97459 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms