Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nbr1P97432 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms