Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LystP97412 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LystP97412 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LystP97412 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LystP97412 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LystP97412 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LystP97412 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
LystP97412 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LystP97412 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LystP97412 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LystP97412 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LystP97412 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms