Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lig3P97386 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lig3P97386 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms