Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SmsP97355 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SmsP97355 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SmsP97355 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SmsP97355 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SmsP97355 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SmsP97355 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SmsP97355 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SmsP97355 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SmsP97355 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SmsP97355 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SmsP97355 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SmsP97355 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SmsP97355 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SmsP97355 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmsP97355 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmsP97355 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SmsP97355 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SmsP97355 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms