Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Arf1P84078 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Arf1P84078 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms