Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Irx1P81068 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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