Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gjb6P70689 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms