Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Smad1P70340 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms