Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gfi1P70338 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gfi1P70338 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms