Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chl1P70232 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chl1P70232 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chl1P70232 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chl1P70232 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chl1P70232 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms