Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbdsP70122 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SbdsP70122 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms