Protein–RNA interactions for Protein: P62918

Rpl8, 60S ribosomal protein L8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl8P62918 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl8P62918 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpl8P62918 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms