Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl30P62889 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl30P62889 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms