Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3cP62823 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3cP62823 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms