Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6P62754 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6P62754 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6P62754 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6P62754 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rps6P62754 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6P62754 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms