Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan5P62080 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan5P62080 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan5P62080 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan5P62080 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms