Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lmo4P61969 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms