Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Depdc5P61460 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Depdc5P61460 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms