Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smg6P61406 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smg6P61406 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Smg6P61406 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smg6P61406 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms