Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b6P59708 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b6P59708 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b6P59708 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms