Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scarf2P59222 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms