Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcif1P59114 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcif1P59114 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcif1P59114 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcif1P59114 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcif1P59114 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms