Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tlr8P58682 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tlr8P58682 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms