Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snrpa1P57784 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snrpa1P57784 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snrpa1P57784 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms