Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtnsP57757 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms