Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samsn1P57725 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samsn1P57725 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms