Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcbp4P57724 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pcbp4P57724 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms