Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lad1P57016 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lad1P57016 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.8 ms