Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Exosc10P56960 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Exosc10P56960 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms