Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc1a3P56564 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc1a3P56564 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms