Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd38P56528 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd38P56528 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms