Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gp1bbP56400 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms