Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtskP55097 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtskP55097 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtskP55097 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtskP55097 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtskP55097 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtskP55097 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtskP55097 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtskP55097 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtskP55097 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtskP55097 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtskP55097 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtskP55097 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtskP55097 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtskP55097 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms