Protein–RNA interactions for Protein: P54276

Msh6, DNA mismatch repair protein Msh6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh6P54276 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msh6P54276 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msh6P54276 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh6P54276 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msh6P54276 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms