Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PctpP53808 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PctpP53808 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PctpP53808 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PctpP53808 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PctpP53808 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PctpP53808 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PctpP53808 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PctpP53808 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PctpP53808 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PctpP53808 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PctpP53808 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PctpP53808 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PctpP53808 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms