Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Upp1P52624 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Upp1P52624 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Upp1P52624 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms