Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr1cP52432 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr1cP52432 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms