Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pold1P52431 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pold1P52431 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms