Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnfP51944 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnfP51944 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms