Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FmodP50608 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FmodP50608 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FmodP50608 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FmodP50608 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FmodP50608 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FmodP50608 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FmodP50608 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FmodP50608 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FmodP50608 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FmodP50608 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FmodP50608 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FmodP50608 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms